Ženám na Slovensku bráni v prístupe k interrupciám aj takzvaná výhrada vo svedomí. Niektoré zdravotníčky a zdravotníci môžu odmietnuť poskytovať služby reprodukčného zdravia z dôvodu náboženského presvedčenia. V praxi však dochádza aj k situáciám, kedy si túto výhradu uplatňujú nielen jednotlivci či jednotlivkyne, ale aj celé zdravotnícke zariadenia.
Takáto prax inštitúcií pritom porušuje zákony a obmedzuje zdravotnú starostlivosť o reprodukčné zdravie žien a dievčat v celých regiónoch Slovenska. Mnohé ženy musia za interrupciou vycestovať, čo stojí čas a peniaze a nie všetky ženy si to môžu dovoliť. Výrazne sa tiež obmedzuje možnosť stihnúť zákrok do 12. týždňa tehotenstva.
